Nos modules

  • Vous cherchez un cahier de laboratoire électronique ? Yu-Note est pour vous.

  • Êtes-vous lassés de chercher les informations sur vos échantillons dans de multiples fichiers Excel ? Yu-Store vous aide à localiser et à trouver rapidement toute les données de vos échantillons.

  • Vous cherchez un outil de biologie moléculaire ?   Yu-Design vérifie vos processus de clonage,  Yu-Clone enregistre les préparations de plasmides, les stocks de glycérol, et analyse les résultats de séquençage. Vous êtes plutôt branché sur la biologie de synthèse ? Yu-Golden Gate gère tous les recombinaisons d'inserts et crée les cartes de plasmide correspondantes en quelques clics!

  • Travaillez vous avec beaucoup de séquences de protéines? Yu-Protein vous aidera à enregistrer toutes vos séquences de protéines ainsi qu'à les aligner avec le "format" attendu. Yu-Produce  permet de suivre la production de protéines (lignées cellulaires, clones, expression et purification) 

Toutes nos applications sont entièrement intégrées, de sorte que vous pouvez naviguer des séquences d'ADN aux protéines, de l'emplacement de l'échantillon à votre cahier de laboratoire électronique. Il n'a jamais été aussi facile de retrouver des informations sur ses données et échantillons! Un service d'hébergement est fourni par Yubsis, donc tout est accessible en ligne ! ​





Yu-Note

                        Le cahier de laboratoire électronique développé par Yubsis 

Digitalisation des données  

Débarrassez-vous des cahiers papiers démodés qui doivent être stockés et archivés dans des placards! Avec Yu-Note, le précieux savoir de vos équipes est entièrement numérique, il est sécurisé et toujours accessible.  

Researcher Friendly

Yu-Note est intuitif et facile. Les chercheurs peuvent écrire leurs expériences en utilisant du texte enrichi et les illustrer avec des images et des tableaux. En tant qu'anciens chercheurs, notre objectif est de fournir à nos clients des outils leur permettant de partager et de stocker facilement l'historique de leurs expériences et de conserver leurs bonnes pratiques de laboratoire.

  Faciliter le travail en équipe

L'auteur principal peut attribuer des rôles à ses collègues : co-auteur, lecteurs, témoins, etc. et peut attribuer à qui il veut des droits de lecture à chaque expérience. Cela facilite le partage contrôlé de l'information dans les équipes de recherche.

 Securisez votre PI 

Pour des raisons de propriété intellectuelle, la validité juridique de votre documentation électronique est essentielle. Au sein de Yu-Note, nous avons mis en place plusieurs niveaux de contrôle afin d'attester la validité de vos résultats de recherche : authentification de l'utilisateur, contrôle strict des droits de l'utilisateur, processus de signature électronique qui aboutit à un fichier pdf final, horodatage du pdf certifié par un tiers agréé, piste d'audit capturant chaque étape du flux de travail.

Les caractéristiques de Yu-Note

Researcher-friendly


 Utilisez une interface d'écriture de type "Word"

 Créez ou copier des tables depuis Excel.

 Liez les fichiers relatifs à vos expériences

 Choisissez les participants et partagez les expériences avec vos collègues

 Annexez les procédures de laboratoires (SOPs) utilisés 

 Liez les matériaux et les équipements utilisés

 Visualisez rapidement l'état d'une expérience (en cours, terminée, signée, horodatée)

 Partagez des modèles d'expériences types. 

 Recherchez facilement des expériences grâce à nue vue en tableau et des filtres par expérimentateur, projet, date, statut, etc.


Des données sécurisées


 Pour sécuriser votre propriété intellectuelle, les expériences sont signées avec une signature électronique et horodatées. 
 
 Suivez le processus de signature. 

 Choisissez les droits d'écriture et de lecture.
 
 Ajoutez des commentaires / feedback sur l'expérience d'un collègue

 Tracer les actions grâce à une piste d'audit qui enregistre les processus étape par étape.

 Exportez et imprimez à tout moment le rapport PDF de vos expériences.

 
 


Yu-Store

                                         Gérer vos stocks

Suivez vos échantillons biologiques

 Enregistrez et suivez les échantillons : préparations de plasmides, lots de protéines, stocks de glycérol, cellules et plus encore.

 Créez toutes les catégories de matériaux nécessaires (réactifs, enzymes, lignées cellulaires, clones, etc)

 Ne perdez plus vos échantillons: leurs emplacements peuvent être décrits avec précision et la position dans la boîte visualisée.

 Trouvez facilement un échantillon, en utilisant le nom, l'alias, la date, le projet ou toutes autres caractéristiques enregistrées.

 Divisez les lots en plusieurs aliquots

 Suivez l'utilisation d'un échantillon et son volume restant.

Suivez les produits provenants de fournisseurs


 Faites l'inventaire des produits commerciaux (consommables, réactifs, ...)

 Réalisez le suivi complet de toutes les transactions relatives aux stocks : réception, livraison, mise à jour, utilisation.

 Localize products or consumables in storage rooms, freezers, etc

 Réservez une partie du stock pour des projets spécifiques (centre de coût)

 Créez des alertes sur des quantités minimales ou des dates d'expirations 

 Enregistrez et associez les informations de sécurité relatives à un produit

 Créez une liste de produit à commander.

Connexion avec un système de e-Procurement

Yu-Store est connecté à la plus grande plateforme belge d'e-procurement pour les sciences de la vie: ​ BIPP.

Tous les fournisseurs sont localisés sur une même plateforme afin que vous puissiez comparer les prix et la disponibilité des articles. De l'e-sourcing, l'e-achat et l'e-facturation, cette plateforme révolutionne et digitalise votre processus d'achat. Lorsqu'une commande est passée, les produits sont directement envoyés à Yu-Store d’où vous pouvez suivre l’évolution du statut de la commande (planifiée, reçue, stockée).

Voici un exemple des champs qui sont automatiquement complétés dans Yu-Store:  

 Les produits, les packaging associés et leurs unités (items, ml, mg, etc) 
 Les quantités

 Le fournisseur et le fabricant avec les numéros de catalogues

 Les dates de réception prévues et factuelles 

 Les projets et les centres de coûts 

 Les prix, etc...

La puissance d'une base de données relationnelle 


 La liaison de tous les échantillons à un projet permet d'avoir un aperçu rapide des étapes réalisées.
 
 C'est un puissant moteur de recherche et de navigation dans toute la base de données.

 Les liens s'établissent entre les éléments qui dérivent les uns des autres, par exemple un clone bactérien recombinant est lié au plasmide utilisé pour la transformation.

 Une base relationnelle permet de retracer l'historique d'un échantillon : date de création, créateur, nom de la construction, volume, livraisons, référence ELN, etc.

Yu-Design
                      Construction de cartes de plasmides

Dessiner vos plasmides


 Visualisez vos séquences ADN de façon circulaire et linéaire.

 Personnalisez vos vues  : choisissez vos groupes d'enzymes préférées, les noms de séquences, les oligonucléotides ou ORFs que vous souhaitez voir apparaitre sur la séquence ADN. 

 Importez vos séquences de plasmides en .gb ou cipier/coller la séquence ADN.

 Adaptez l'origine, éditez la séquence pour enregistrer des modifications sans erreurs (délétions, additions, substitutions) 

 Utilisez les annotations automatiques : les séquences spécifiques sont automatiquement reconnues par le module et annotées sur le plasmide.

 Liez les plasmides aux projets ainsi qu'à tous ses échantillons dérivés: préparation de plasmides, stocks glycérols, cellules, clones, protéines, aliquots, etc.. 

Vérifiez vos processus de clonage et évitez les erreurs


 Les processus de clonage peuvent être simulés pour éviter les erreurs. Les inserts peuvent provenir de produits de restriction du plasmide, de synthèse d'ADN ou d'amplification par PCR.

 Utilisez différents types de clonages: ligation classique, 'infusion', la recombinaison de la levure, ou le 'Golden Gate'.

 
 La création de nouvelle carte de plasmide est automatique.

 
 Conservez l'historique de la construction.

Yu-Clone

                   Analysez la séquence ADN de vos échantillons              

Analysez vos résultats de séquençage 


 Retrouvez toutes vos amorces dans la même table et trouvez automatiquement des informations telles que la température de fusion, la teneur en GC, la longueur, le poids moléculaire, etc.


 Trouvez en un clic si vous avez déjà des amorces adéquates dans votre laboratoire. Si besoin, Yu-Clone vous aide aussi dans la conception d'amorces supplémentaires.


 Comparez les résultats du séquençage à la carte de plasmide attendue. Yu-Clone aide à l'identification des mésappariements et permet une correction manuelle si nécessaire.


 Remplissage automatique du "statut de l'analyse", en fonction des résultats du séquençage (invalidé, partiel, validé).

Yu-Golden Gate 

                                   La biologie synthétique, c'est facile!

MoClo (Modular Cloning)


Yu-Golden Gate vous aide à travailler avec les standards MoClo, Ecoflex mais aussi CIDAR, les standards pour la levure et les plantes. Il vous permet également de concevoir votre propre standard, avec la personnalisation des sites de fusion et des modèles d'assemblage. La cohérence de votre standard est vérifiée automatiquement.

 Identification automatique des parties du Golden Gate dans vos plasmides

 Obtenez en un clic toutes les 'parts' compatibles avec les sites de fusion spécifiques et les enzymes de restriction de type IIS.

 Yu-Golden Gate trouve en 1 clic tous les vecteurs accepteurs compatibles à votre clonage. 

 Yu-Golden Gate permet le clonage combinatoire in-silico et crée tous les pladmides que vous souhaitez en quelques clics.

 Les volumes à prélever pour chaque 'parts'/plasmides sont calculés et prêts à être envoyés à votre robot de pipetage préféré.

Yu-Protein 

                       Enregistrez toutes vos protéines 

Yu-Protein est un module d'enregistrement des produits biologiques. Il possède des fonctionnalités avancées pour la description et l'analyse du format des protéines. Elles sont particulièrement utiles pour l'analyse des séquences d'anticorps, mais s'appliquent à tous les produits biologiques, sans limitation.

 L'annotation et la traduction est automatique. 

 Les nouvelles protéines sont comparées aux protéines existantes afin de garantir leur caractère unique.

 L'analyse de la séquence des protéines est effectuée selon le format déclaré. Dans le cas d'un anticorps, la séquence germinale la plus proche est trouvée et les CDR sont identifiés sur la base de l'alignement.

 Yumatix étant une base de données relationnelles, la séquence est automatiquement déduite de vecteur d'expression.

Yu-Produce 

                          Suivez les étapes d'expression, purification et caractérisation des protéines 

Consolider vos données de production de protéines 


 Enregistrez votre système d'expression : bactéries, lignées cellulaires de mammifères, levures, hybridomes ou hôtes recombinants.

 Indiquez vos résultats d'expression obtenu avec le système d'expression choisi (concentration of produced protein, volume, etc).

 Entrez les étapes de purification, les tampons, la concentration finale des lots de protéines, les tag de clivage. 

  Partager ces données au sein d'un groupe de scientifiques via une base de données unique.

 Créer des aliquots et préciser leur localisation.


Yu-Select 

                          Organisation et analyse des cribles d'anticorps

Organisez votre campagne de sélection


 Construisez votre stratégie de sélection sous forme d'arbre

 Créez un nouveau bras de sélection directement à partir de l'arbre

 Les facteurs d'enrichissement sont calculés automatiquement

 résultats d'ELISA: importez les données depuis les lecteurs d'absorbance et stocker les résultats (plaques 96 puits ou 384 puits) .

 Créez des plans de plaque modèles (choix des emplacements spécifiques pour les contrôles)

 les clones positifs sont facilement repérables.


Création de Hit-List:


 Suivez les campagnes de sélection d'anticorps grâce à un tableau généré automatiquement

 Choisissez vos anticorps d'intérêt en réalisant une 'Hit-List': des filtres peuvent être positionnés pour aider à cette sélection

 Créez des Hit-Lists à différentes étapes du processus de sélection d'anticorps

 Ré-arrangez les Hit-List pour sécuriser les meilleurs clones dans une nouvelles plaque glycérol (re-séquençage, re-formatage,..)

 Re-formatez une Hit-List: collez les séquences d'anticorps dans un autre vecteur pour les convertir dans un autre format thérapeutique pertinent.

Yu-Project

                            Gérer vos projets

Contrôler l'avancé de vos projets en temps réel



 Créer des projets et désigner un manager

 Créer des étapes de travail et les sous étapes associées.

 Grâce à des symboles de couleurs, visualisez rapidement si les étapes sont terminées, en cours ou à venir.

   Attachez tous types de documents au projet 

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